Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk2a2O54833 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms