Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf18O35714 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf18O35714 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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