Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2O35245 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms