Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhe40O35185 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms