Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Nedd9O35177 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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Nedd9O35177 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Nedd9O35177 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Nedd9O35177 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd9O35177 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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