Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgisO35074 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgisO35074 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgisO35074 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgisO35074 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgisO35074 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtgisO35074 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtgisO35074 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtgisO35074 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms