Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec22bO08547 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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