Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
U90926O08546 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
U90926O08546 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
U90926O08546 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms