Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms