Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700014D04RikJ3QMS2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms