Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4bG5E8Z2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4bG5E8Z2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms