Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp6G5E8P0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp6G5E8P0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms