Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip12G5E870 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip12G5E870 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms