Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcf11G3X9Z4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcf11G3X9Z4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcf11G3X9Z4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms