Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn2r85G3UW56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn2r85G3UW56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r85G3UW56 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r85G3UW56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r85G3UW56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r85G3UW56 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn2r85G3UW56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms