Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhox13F6YCR7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox13F6YCR7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms