Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms