Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms