Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r40F6W043 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r40F6W043 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms