Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17555F6U8B9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17555F6U8B9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms