Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Dnah11E9Q7N9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Dnah11E9Q7N9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Dnah11E9Q7N9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Dnah11E9Q7N9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms