Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc85cE9Q6B2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms