Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtproE9Q612 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms