Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17727E9Q4V7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17727E9Q4V7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms