Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E430018J23RikE9PZQ8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms