Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scaf11E9PZM7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf11E9PZM7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms