Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cngb1E1AZ71 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms