Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo5D3YW29 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo5D3YW29 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms