Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smok3bC0HKC9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smok3bC0HKC9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms