Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms