Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cfap58B2RW38 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms