Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usf3B2RUQ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf3B2RUQ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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