Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms