Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf518bB2RRE4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms