Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf3B2RQG2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms