Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms