Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2012B1B0R1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm2012B1B0R1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms