Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nipsnap3aB1AWZ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nipsnap3aB1AWZ3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms