Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930402K13RikB1AW18 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930402K13RikB1AW18 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms