Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NhsB1AV60 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NhsB1AV60 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms