Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik3B1AS29 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms