Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Atp8b5A3FIN4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Atp8b5A3FIN4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp8b5A3FIN4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Atp8b5A3FIN4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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