Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ism1A2ATD1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms