Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn3aA2ASI5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn3aA2ASI5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms