Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Patl2A2ARM1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms