Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FocadA2AKG8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FocadA2AKG8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms