Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmpd1A2AKB4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd1A2AKB4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms