Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm16A2A935 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms