Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm2A2A7B5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm2A2A7B5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms