Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrp1bA1Z198 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms